美國NIST RM 8375 微生物基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品

貨號：RM 8375

品牌：美國NIST

英文名稱:

Microbial Genomic DNA Standards for Sequencing Performance Assessment

(MG-001, MG-002, MG-003, MG-004)

中文名稱：用于測序性能評估的微生物基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品 (MG-001, MG-002, MG-003, MG-004)

產(chǎn)品規(guī)格: 4 vials, 1 each

產(chǎn)品用途：

本參考物質(zhì)（RM）用于微生物全基因組測序的驗證、優(yōu)化、過程評估和性能評估。特別關(guān)注了對基因序列的評估。RM 8375的單位由四個小瓶組成。每個小瓶含有不同的微生物基因組DNA樣本（MG-001、MG-002、MG-003銅綠假單胞菌和MG-004產(chǎn)孢梭菌）。

該材料旨在幫助評估高通量微生物DNA測序方法的性能。這種基因組DNA是從細(xì)胞培養(yǎng)物中提取的。由于RM是提取的DNA，因此它不評估DNA提取等預(yù)分析步驟。然而，它確實對測序庫的準(zhǔn)備、測序機、堿基調(diào)用算法以及隨后的生物信息學(xué)分析提出了挑戰(zhàn)。本RM不用于評估其他生物信息學(xué)步驟，如菌株鑒定、系統(tǒng)發(fā)育分析或基因組注釋?；蚪MDNA的純度被評估為適合這些目的。

儲存和使用說明：

儲存：

RM 8375在NIST儲存在-20°C下，但將與冷凍包一起運輸，可能不會冷凍到達(dá)。收到后，RM 8375應(yīng)在-20°C的黑暗中長期儲存，或在4°C的陰暗中短期儲存（如果使用可能在大約8周內(nèi)）。

使用說明：

建議使用基因組序列來評估變異調(diào)用的準(zhǔn)確性，而不是基因組組裝，因為正交測量方法對基因組序列結(jié)構(gòu)存在分歧，無法解決這些差異。由于用于評估堿基調(diào)用準(zhǔn)確性的方法的復(fù)雜性以及基因組序列中潛在的錯誤，強烈建議用戶人工檢查具有高堿基調(diào)用錯誤率的推定區(qū)域周圍的對齊讀取。參考文獻(xiàn)3概述了評估微生物基因組中變異調(diào)用的良好實踐。

這些組件基于多種測量方法的數(shù)據(jù)；我們使用多種正交方法對材料進(jìn)行了評估，以盡量減少與單個平臺相關(guān)的系統(tǒng)誤差的影響。這些數(shù)據(jù)可在國家生物技術(shù)信息中心（NCBI）序列讀取檔案（SRA）中獲得，分別為MG-001、MG-002、MG-003和MG-004的生物樣本SAMN02854572、SAMN02854573、SAMN02954574和SAMN02854275[4]。隨著測序技術(shù)和分析方法的改進(jìn)，基因組序列將在Github網(wǎng)站上更新并可用（見上文“信息值"）。新的版本號將指示更新的基因組序列以及描述更改的文本文件。識別參考基因組中錯誤的用戶可以在參考文獻(xiàn)5所示的網(wǎng)站上發(fā)布他們的結(jié)果，確認(rèn)的錯誤將被納入下一次序列更新中。

美國NIST RM 8375 微生物基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品   原廠訂貨，貨期短，質(zhì)量保證，售后完善。

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